Der GIH besitzt eine regionale Struktur.
13 rechtlich eigenständige Landesverbände bilden die Mitgliedschaft des Bundesverbands GIH e.V. Dieser fungiert als Dachverband und bundesweite Interessenvertretung des GIHs. Die einzelnen Energieberater sind Mitglieder im entsprechenden Landesverband.
Alle Landesverbände treten als eingetragene Vereine mit gewählten Vorständen auf. Ihre Gebiete orientieren sich in der Regel an bestehenden Bundeslandesgrenzen. Dank seines regionalen Aufbaus kann der GIH die Betreuung der Energieberater vor Ort gewährleisten. Landesverbände sind landespolitisch aktiv und vertreten die Interessen der Energieberater, wenn zum Beispiel Landesgesetze geändert oder Förderungen auf regionaler oder Landesebene entstehen bzw. novelliert werden.
Die ersten Landesverbände gründeten sich 1999 als GIH Gebäudeenergieberater im Handwerk e.V. und schlossen sich nur zwei Jahre später zum Bundesverband GIH Gebäudeenergieberater Ingenieure Handwerk e.V. zusammen.